廣東醫科大學附屬醫院肛腸外科源自胃腸外科肛腸專業小組，形成以結直腸肛門疾病的診斷和治療為特色，集醫療、教學、科研于一體綜合發展的專業化科室。肛腸外科現擁有33張床位的獨立病區，設肛腸專家門診及普通門診，年門診量一萬多人次；每年住院約2000人次，年手術量近1300人次?？剖揖邆淇茖W化的人員結構梯隊，醫療團隊中博士生導師1人、碩士生導師2人；廣東省杰出青年醫學人才1人，廣東省醫師協會胃腸外科分會副主任委員1人；主任醫師3人，教授1人，副主任醫師1人，雙師型人才1人；博士2人，碩士5人，本科2人。護理團隊中副主任護師1人，主管護師3人，護師3人，具有國際認證的造口治療師1人。肛腸外科長期負責廣東醫科大學肛腸外科學研究生的培養工作，系廣東省醫師協會胃腸外科分會副主任委員單位，科室多位專家與科室技術骨干在廣東醫學會等專業協會及團體擔任學術職務?？剖揖邆溽t療科技攻關的實力和技術含金量，科室人員曾主持國家自然科學基金2項，廣東省自然科學基金1項，在國際知名雜志Intenational Journal of Cancer等發表多篇SCI論文。

肛腸外科目前開展常見病、多發病及疑難雜癥的診斷及治療，微創手術在粵西地區屬領先地位?？剖夷荛_展的手術有：結直腸癌的腹腔鏡微創手術、機器人微創手術、經自然腔道取標本手術（NOSES）手術、直腸癌神經功能保護手術、直腸癌保肛手術；肛瘺掛線術；肛瘺拖線引流術；高位復雜性肛瘺切開掛線術；重度痔PPH術；痔RPH手術、TST手術；肛裂切除術；肛門側切松解術；直腸前突經直腸修補術；肛管狹窄縱切橫縫術或Y-V成形術；各種良惡性直腸腫物經直腸或骶尾部切除術，直腸脫垂Delorme術、Altemeier術,骶尾部藏毛竇Limberg皮瓣轉移術，陳舊性重度會陰損傷重建術等。